Doctora en Historia por la Universidad Autónoma de Madrid, es Profesora Propia Agregada del Departamento de Filosofía y Humanidades de la Universidad Pontificia Comillas. Miembro del Instituto Universitario «La Corte en Europa» (IULCE) perteneciente a la Universidad Autónoma de Madrid, ha participado en diversos proyectos de I+D vinculados al mismo, y es coautora de varias obras colectivas que estudian las Cortes de Carlos V, Felipe II, Felipe III y Felipe IV.
Es directora de la Colección de libros «Textos para un Milenio», promovida por la Orden del Carmen, cuya finalidad es recuperar textos carmelitas que, o bien no son fáciles de encontrar o bien nunca fueron traducidos al castellano o incluso nunca fueron publicados. Se incluyen en la misma textos literarios, teológicos, espirituales, histórico, etc., acompañado de dos estudios introductorios de expertos en el tema: uno sobre el autor y otro sobre la temática tratada en el libro. En este sentido, Henar Pizarro ha dedicado varios trabajos a la figura de Jerónimo Gracián de la Madre de Dios.
Autora del libro Un gran patrón en la Corte de Felipe II. Gaspar de Quiroga. (Universidad Pontificia Comillas 2004), ha continuado desarrollando trabajos que abordan la historia de la Inquisición española.
Así mismo, en los últimos años, cabe destacar las investigaciones realizadas en relación con la Casa de la reina Isabel de Borbón, primera esposa de Felipe IV. Destaca igualmente en su quehacer la organización del Congreso Internacional y la publicación de los tres volúmenes titulados Los jesuitas. Religión, política y educación (siglos XVI-XVIII). J. Martínez Millán, H. Pizarro Llorente, E. Jiménez Pablo (Eds.) Madrid 2012, así como, en este mismo año la publicación de dos volúmenes: Henar Pizarro Llorente (dir.), José García de Castro Valdés (ed. lit.), Macarena María Moralejo Ortega (ed. lit.), Wenceslao Soto Artuñedo (ed. lit.), Jesuitas. Impacto cultural en la monarquía hispana (1540-1767). Grupo de comunicación Loyola, 2022.
En este sentido, la profesora Pizarro tiene diversos trabajos en torno a la figura de San Francisco de Borja.
El Pregón de la Semana Santa de Gandia tendrá lugar el próximo 26 de marzo de 2023 en la Iglesia de las Escuelas Pías.